Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM41Q8WV44 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms