Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms