Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC33Q8N5R6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms