Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC117Q8IWD4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC117Q8IWD4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms