Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUFY3Q7L099 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms