Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

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Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZNF449Q6P9G9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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