Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms