Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms