Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SAMD4B-213ENST00000610417 3664 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms