Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIS6

ZNF528, Zinc finger protein 528, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF528Q3MIS6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF528Q3MIS6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms