Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms