Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms