Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms