Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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