Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FXNQ16595 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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