Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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