Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SSX1Q16384 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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