Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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