Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP6AP1Q15904 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms