Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RABEP1Q15276 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RABEP1Q15276 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RABEP1Q15276 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RABEP1Q15276 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RABEP1Q15276 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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