Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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