Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EFR3AQ14156 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms