Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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COL4A6Q14031 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms