Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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