Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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