Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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