Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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