Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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IFT88Q13099 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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