Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms