Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms