Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH1Q08174 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCDH1Q08174 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCDH1Q08174 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCDH1Q08174 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCDH1Q08174 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCDH1Q08174 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH1Q08174 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH1Q08174 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH1Q08174 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms