Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FMODQ06828 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FMODQ06828 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms