Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms