Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FAM3AP98173 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FAM3AP98173 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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