Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms