Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN2P57739 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms