Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms