Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK8P49336 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK8P49336 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK8P49336 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms