Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNT2P45379 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms