Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV4P43268 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV4P43268 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV4P43268 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms