Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms