Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms