Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms