Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APCP25054 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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APCP25054 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
APCP25054 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
APCP25054 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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