Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP24386 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHMP24386 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
CHMP24386 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP24386 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHMP24386 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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