Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NFKB1P19838 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKB1P19838 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NFKB1P19838 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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