Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGA1P17096 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms