Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms