Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms