Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms